迷你西游中的神通系统是游戏核心玩法之一，指护法角色特有的被动技能体系。每个护法最多拥有四个神通技能，这些技能在战斗中自动触发，直接影响战局走向。神通分为天赋神通和可激活神通两类，天赋神通随护法解锁自动获得，而第四神通往往需要特定条件激活。神通效果涵盖攻击增益、防御强化、状态控制等多种类型，合理搭配不同神通是组建强力阵容的关键因素。
神通加点需要消耗同名卡牌提供的神通点，五星护法初始拥有15个神通点，每张同名卡可增加2点。由于资源有限，加点策略需根据护法定位进行取舍。攻击型护法优先提升暴击、连击等输出类神通，防御型护法则侧重元形、护盾等生存技能。部分特殊神通如元形能吸收相邻护法生命值并承担伤害，这类战略技能往往需要优先点满。神通觉醒是进阶玩法，红色神通强化至15级后可开启，通过消耗觉醒宝玉获得额外属性词条。
神通之间存在明确的克制关系，例如驱雷类神通对水系护法有额外效果，而弱化类神通能有效抵消敌方增益。战斗时需注意敌方阵容的神通组合，针对性调整站位和出手顺序。疯魔类神通虽能提升攻击但会消耗生命值，这类高风险高收益的技能需要搭配治疗型护法使用。布剑、诛仙阵等范围型神通适合后排输出位，而挥扫、突袭等单体技能则更适配前排角色。
获取神通点主要通过护法合成、任务奖励和活动参与等途径。同名护法合成不仅能提升境界，还能转化为神通点用于技能升级。部分特殊神通如入阵需要在战斗开始时触发，这类技能往往能改变战场格局。装备两个同类型但效果不同的神通时，系统只会生效后装备的那个，因此需要合理规划神通搭配顺序。随着游戏进程推进，高阶神通的效果会逐渐显现，成为后期战斗的决定性因素。
神通系统的深度体现在技能联动的策略性上。例如元形护法配合疯魔技能可形成攻守兼备的体系，而治疗类神通又能弥补这类组合的生存缺陷。护法的有缘装备和法术往往能强化特定神通效果，这种关联设计增加了培养路线的多样性。战斗节奏把控需要考虑神通触发概率和冷却时间，这些隐藏机制需要通过实战不断摸索。神通并非孤立存在，其价值需要通过整体阵容搭配才能完全体现。
