口袋妖怪火红中切断树木的核心是获取秘传机HM01居合斩、拿到华蓝市道馆徽章并让宝可梦学会技能，之后就能对地图上的小树使用居合斩清除障碍。
获取居合斩需先完成正辉支线拿到圣安奴号船票。流程为从华蓝市向右走25号道路，抵达正辉的小屋，帮助他从皮皮形态恢复人形后，即可获得船票。随后前往枯叶市码头，凭船票登上圣安奴号游轮，游轮内有不少训练师可对战，在顶层甲板会遭遇劲敌，击败后前往船长室，帮助晕船的船长按摩背部，就能获得HM01居合斩，游轮会随即离港，需一次性完成该流程。
使用居合斩前必须先获得华蓝市道馆的湛蓝徽章，否则无法在战斗外使用该技能。华蓝市道馆馆主使用水系宝可梦，击败她后就能解锁居合斩的野外使用权限，同时保证30级以下宝可梦服从指挥。拿到徽章和秘传机后，打开背包选择HM01，指定队伍中合适的宝可梦学习，普通系、格斗系宝可梦适配性最佳，建议让交通工具型宝可梦掌握，不占用战斗宝可梦的技能栏。
实际砍树时，操控角色走到挡路的小树前，系统会自动触发交互提示，选择使用居合斩后，小树会直接被切断，道路随即打通。这类可切断的树木是地图上的矮小灌木，区别于不可交互的高大树木，切断后永久消失，可用于探索枯叶市道馆、1号道路等被树木阻挡的隐藏区域，收集道具或解锁新路线。
居合斩除了砍树，战斗中作为普通系物理技能，具备必中特性，前期可作为过渡输出手段，对岩石、钢系宝可梦效果较弱。探索时可搭配闪光、碎岩等秘传机，提前规划宝可梦技能配置，避免反复更换宝可梦影响探索效率，熟练掌握居合斩的获取与使用，能大幅提升前期地图探索的流畅度。
