培养神器需要两种核心材料：忍玉和轮回石。忍玉用于提升神器等级，每10个忍玉可强化一次，强化后增加角色的生命、攻击和防御属性。轮回石则专门用于洗练神器附带的雕文属性，每次洗练固定消耗5个轮回石，通过调整雕文的品质（绿色、蓝色、紫色等）来优化战力加成。这两种材料的日常获取途径需重点规划，忍玉可通过小队突袭、生存挑战、组织叛忍活动及每日签到稳定积累，修行之路通关也能提供一定数量。轮回石产出相对有限，主要依赖每日签到、组织叛忍、小队突袭及运营活动，因此需优先用于关键阶段。
不同阶段的神器消耗材料性价比差异显著，需针对性分配资源。以神器白牙为分界点，白牙之前的神器（如幌金绳、七星剑等）消耗忍玉和轮回石较少，但战力提升稳定，建议优先将其升至满级并洗练雕文至较高品质。而白牙及之后的神器（如平目鲽、双袭牙等）升级所需忍玉量大幅增加，雕文洗练消耗的轮回石翻倍（如白牙后每次洗练需60轮回石），但属性收益反而减半。合理策略是在解锁白牙后，回溯将前期神器平均升满，再处理高阶神器，避免材料浪费。
雕文洗练是提升战力的关键操作，每个神器拥有三个雕文槽位，洗练时可随机刷新品质与数值。初期建议不锁定任何属性，以最低消耗（5轮回石/次）反复洗练，直至出现紫色等高阶属性再替换。若锁定属性，每锁定一条会额外增加轮回石消耗（如锁定一条需15轮回石），因此除非遇到优质属性，否则初期避免锁定。雕文属性存在上限，需先将神器升至当前阶段满级，才能继续提炼雕文至最大值。
神器解锁遵循线性顺序，前一个神器达到特定等级（如70级或140级）才能激活下一个。幌金绳通关第四章后自动解锁，七星剑需幌金绳达70级，红葫芦需七星剑70级并通过指定关卡。每个神器升级至固定等级（如20级、40级）会逐步解锁雕文槽位，需同步投入轮回石进行洗练。后期神器如白牙需升至280级满级，消耗忍玉高达239万，轮回石约56.7万，因此前期资源规划尤为重要。
组织商店中可用功勋兑换轮回石和忍玉，但优先兑换轮回石因其更稀缺；忍玉充裕时可适度兑换。多余的神器材料（如低级忍具）可分解回收忍玉之尘，用于强化高阶究忍具。重复的究忍具可放入忍具收藏馆激活藏品属性，直接提升固定战力，避免合成损耗。日常务必完成秘境挑战、佩恩入侵副本以获取忍具之尘和究忍具，支撑中后期培养需求。
