第二层的真正挑战在于分布在每一关的障碍，以及复杂的迷宫路线。玩家需要细心观察地图，记忆每一段路线，才能避开障碍，找到通往下一关的路。运气也是一个关键因素，有时候走错一步也可能造成整个进程的失败。
第二层有一个特点，那就是这里的妖怪种类繁多，而且每种妖怪都有自己的特色技能以及属性，这要求玩家需要有足够的口袋妖怪知识，才能有效地制定打击策略。有的妖怪拥有强大的防御能力，就需要你的妖怪有强力的攻击技能，而有的妖怪拥有高的闪避能力，你就需要选择命中率高的技能。
这一层的妖怪等级普遍比较高，所以在进行挑战之前，育成合适等级的妖怪是很重要的。若玩家的妖怪等级不足，那么再好的策略也会因为输出伤害不足而失败。在挑战天空之柱的第二层之前，充分利用空闲时间进行妖怪练级显得特别重要。
玩家需要在挑战这一层时，准备一些必要的供给品，例如回复药水、驱毒草等，这样能够在战斗中随时调整策略，保持妖怪的战斗力。
与此合理的妖怪出场顺序也是非常关键的一个点。你可以将防御型的妖怪作为先手，吸收对手的伤害，然后通过适当的换人策略，使得攻击型的妖怪有机会进行反击。
这一层的结束就是本关的BOSS战，BOSS的实力特别强大，要想战胜它并不容易，玩家需要争取在和BOSS的战斗中保持足够的耐力和战斗力，为此，挑战前的妖怪选择、行动策略都将影响着这场对决的结果。
挑战“口袋妖怪天空之柱”第二层的关键是把控合适的战斗节奏，运用适当的策略，以及掌握妖怪的特性；其次就是在挑战之前进行充足的准备工作，包括妖怪的培育，策略的制定，拓宽应对方案。保持一颗冷静的头脑，正确的判断和决策也是通过这一关的重要因素。
“口袋妖怪天空之柱”的第二层虽然困难重重，但只要玩家有耐心、有明确的目标和合理的策略，就一定可以攻克这个挑战。而成功的通过后，也将为玩家带来更多的乐趣和成就感。
