江南百景图里手动栽种下去的景观树木不能直接拆除销毁，需要进入布局编辑模式，选中树木收纳进仓库，仓库内的树木可以留存备用，也可用来和严大人交易兑换积分换取稀有装饰。很多玩家容易混淆地图原生枯木和自行种植的树木，原生枯木可以直接点击清除，玩家手动摆放的各类观赏树、花树没有清除选项，直接点击树木不会弹出清除按钮，这也是不少玩家处理树木时踩坑的主要原因。
处理种下去的树木时，点击屏幕底部的修改布局按钮，进入城市布局编辑界面，点击地图上多余的树木，即可将树木收纳至仓库，收纳之后树木不会直接消失，完整保存在仓库装饰物分类当中，不会有任何资源返还，也不会产生损耗。地图布局复杂，树木被建筑、围墙遮挡时，可以开启地基模式，方格视角下所有装饰物位置清晰可见，能够精准选中被遮挡的树木，避免反复点选建筑却无法选中树木的情况，大幅提升整理园林布局的效率。收纳完成之后退出布局模式，确认地图上树木已经消失，打开仓库的装饰物栏，就可以看到刚刚收回来的全部树木。
仓库中堆积大量树木之后，等待严大人到访城市，即可用树木兑换交易积分，普通景观单棵树木可以提供2点交易积分，积攒足够积分之后，就能兑换百年银杏、参天巨松这类平时很难获取的高品级园林装饰。需要注意树木的积分数值普遍偏低，想要兑换高价值摆件，需要囤积几十棵甚至更多树木，不建议零散少量树木就进行交易，优先囤积批量树木再完成兑换，能减少来回操作的繁琐。如果暂时不想交易，仓库的树木可以跨府转运，通过码头运输到其他城市，用于其他府的园林造景，实现装饰资源跨城市循环利用。
规划城市布局阶段，提前规划树木栽种位置，能够减少后续反复收纳树木的工作量。树木除了美化街区，还可以提升地块环境和谐度，生产建筑周边出现红色低和谐提示时，在附近栽种树木就可以改善环境评级，适配民居、书院这类建筑的周边需求。栽种时尽量成片规划园林区域，不要零散随意铺满空地，既可以避免后期大面积收纳整理，也能打造更贴合江南风格的城市风貌。需要区分景观树和产出型树木，桑树、竹林这类生产资源建筑，和普通观赏树操作逻辑不一样，生产树木可以直接拆除，和手动栽种的装饰树木处理方式完全不同，操作前需要分清树木类型，避免误操作。
