秘密纸条是很早就加入到游戏中的收集品，在第一年冬季来到巴士站就可以触发前置任务，任务要求玩家找到暗影人的踪迹，通过雪地上的脚印，来到游乐场区域的灌木丛处，与之互动和就会有暗影人出现，并送给玩家一个放大镜作为赔礼。在此之后玩家就可以通过多种方式来获取秘密纸条，秘密纸条在最初得到时是以物品出现的，拿起纸条右键阅读就可以将其加入到菜单栏中，下再次查看也是需要在菜单栏的收集品分类找到。
纸条有着多种内容，有些是详细介绍了村民的礼物喜好，有些则是在阅读后会获得特殊任务。解密图片类的秘密纸条，一般都是为玩家提供了隐藏物品的指引，这些秘密物品也都是游戏进程里不可错过的。秘密纸条#13写有很明确的信息指引，在每个季节的最后一天，中午12点整的是时候，来到游乐场灌木丛互动可以得到"祝尼魔毛绒玩具"，这是一件家具装饰，单人档中正常情况是只能获取一件。
纸条#14也是在附近能找到的物品，来到社区中心背后，贴墙走会在右侧遇到阻碍，此时用稿子互动就可以得到石祝尼魔雕像，这个雕像是在每年春2刷新，只要没加入joja会员就能重复获取。纸条#15是一串数字，这也是冬季夜市里观看美人鱼表演的解密提示，根据数字的顺序敲击贝壳就能得到珍珠物品。
